AlphaFold를 활용해 유전자 편집 단백질을 재설계하여 비표적 편집을 줄이다

유전체 크기와 드문 서열 일치로 인해 유전자 편집에서 비표적 편집이 누적되는 안전성 문제가 발생한다는 맥락에서, 연구진은 AlphaFold의 단백질 구조 예측 능력을 설계 단계에 결합해 비표적 활성을 일으키는 구조적 영역을 식별하고 그 부위를 변경하는 방식으로 편집 효소를 재설계했다. 이 방식은 서열을 입력으로 구조를 예측한 뒤 예측된 표면 잔기와 결합 가능한 부위를 도출해 해당 부위를 변형하는 일련의 계산적 설계와 실험적 검증 흐름으로 작동한다. Nature에 보고된 결과를 근거로 계산적 예측을 활용한 단백질 재설계가 비표적 편집을 줄이는 실용적 경로를 제시했으나, 예측 정확도와 실험적 검증의 범위, 그리고 새로운 변형이 유발할 수 있는 예기치 않은 상호작용은 여전히 검증이 필요한 한계로 남아 있다.